Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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