Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFLP07196 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFLP07196 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFLP07196 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFLP07196 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFLP07196 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFLP07196 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms