Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPRP00739 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPRP00739 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPRP00739 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPRP00739 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPRP00739 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HPRP00739 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms