Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F6O75461 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F6O75461 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F6O75461 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F6O75461 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F6O75461 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms