Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms