Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SELENOFO60613 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SELENOFO60613 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SELENOFO60613 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms