Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms