Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A7O00341 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms