Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms