Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms