Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms