Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB5A4FU69 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB5A4FU69 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms