Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF22A3QJZ6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms