Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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