Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms