Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms