Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF8Q9UPP1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms