Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI1Q9ULC6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms