Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms