Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms