Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms