Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRBP1Q9P2E9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms