Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRFN1Q9P244 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms