Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms