Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SH3BP4Q9P0V3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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