Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTLNQ9NXG0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTLNQ9NXG0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms