Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms