Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHST12Q9NRB3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms