Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms