Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPJQ9HC77 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPJQ9HC77 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms