Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM27Q9HBJ8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms