Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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C20orf27Q9GZN8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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C20orf27Q9GZN8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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C20orf27Q9GZN8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C20orf27Q9GZN8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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C20orf27Q9GZN8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C20orf27Q9GZN8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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