Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms