Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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FOXQ1Q9C009 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXQ1Q9C009 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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