Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms