Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNPPD1Q9BV87 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNPPD1Q9BV87 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms