Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms