Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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