Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms