Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN18Q99952 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN18Q99952 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN18Q99952 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN18Q99952 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN18Q99952 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN18Q99952 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN18Q99952 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN18Q99952 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms