Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms