Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRBNQ96SW2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms