Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP4Q96P64 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms