Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD27Q96NW4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms