Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCARF2Q96GP6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCARF2Q96GP6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms