Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC35A4Q96G79 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC35A4Q96G79 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms