Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SMIM12Q96EX1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SMIM12Q96EX1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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