Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms