Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms