Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPTSSAQ969W0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPTSSAQ969W0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPTSSAQ969W0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SPTSSAQ969W0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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